Исследователи создали глобальную библиотеку штрих-кодов для древесных пород

Китай стал ведущим экспортером изделий из древесины и импортером сырья. Незаконные рубки представляют серьезную угрозу биоразнообразию и экосистемным услугам и ведут к обезлесению. Точная идентификация видов древесины — важный шаг для борьбы с незаконными рубками и потерей лесов.

ДНК-штрихкодирование считается перспективным молекулярным инструментом для идентификации видов с использованием коротких стандартизированных фрагментов ДНК. Однако до сих пор не существовало надежной референсной базы ДНК для экономически и экологически важных древесных пород.

В исследовании, опубликованном в Molecular Ecology Resources, ученые из Тропического ботанического сада Сишуанбаньна (XTBG) Китайской академии наук и их коллабораторы создали комплексную библиотеку штрих-кодов, используя четыре распространенных маркера (rbcL, matK, trnH–psbA и ITS2). Она охватывает 1550 коммерчески значимых древесных видов (656 родов из 124 семейств) из Китая и других стран.

«База данных включает множество новых последовательностей, которые обогатят существующие базы штрих-кодов для тропических и субтропических вечнозеленых древесных пород Китая», — сказал профессор Ли Цзе, руководитель исследования.

Ученые оценили эффективность четырех локусов ДНК-штрихкодов для идентификации угрожаемых видов из Красного списка высших растений Китая. Они обнаружили, что фрагмент ITS2 был наиболее эффективным локусом для идентификации китайских древесных видов среди четырех протестированных маркеров, как на видовом, так и на родовом уровне, несмотря на его низкую скорость амплификации.

В целом, ITS2 оказался лучшим одиночным маркером для китайских видов. Однако комбинация штрих-кодов matK+trnH–psbA+ITS2 продемонстрировала большую разрешающую способность для различения близкородственных видов в наборе данных, охватывающем разнообразные международно торгуемые породы древесины.

Хотя ДНК-штрихкодирование в этом исследовании не смогло идентифицировать все образцы до уровня вида, во многих случаях оно может предоставить дополнительные доказательства в сочетании с рутинными методами идентификации. Оно также позволяет проводить быструю и точную проверку незаконно заготовленных организмов.

«Создание референсных библиотек штрих-кодов древесных пород представляет собой ценный ресурс для ряда приложений, включая управление лесным хозяйством и правоохранительную деятельность, экологические исследования и сохранение биоразнообразия», — отметил Ли Цзе.