Ученые предлагают стандартные ДНК-штрихкоды для растений

Исследователи из Университета Британской Колумбии в составе международной команды предложили стандарты для ДНК-штрихкодирования наземных растений. Эта система может стать универсальным инструментом для идентификации более 400 000 видов и помочь в сохранении биоразнообразия.

ДНК-штрихкоды, основанные на участках ДНК, уже успешно применяются для идентификации видов во многих группах животных. Однако для растений эта задача сложнее из-за меньшей вариабельности ДНК между видами.

Международная команда ученых из более чем 20 институтов после четырехлетнего исследования выбрала два геномных региона — гены rbcL и matK — в качестве лучших кандидатов для создания штрихкодов. Результаты опубликованы в Proceedings of the National Academy of Sciences.

«Мы выбрали участки ДНК, которые присутствуют у подавляющего большинства растений, их можно легко и точно секвенировать, а в комбинации они дают почти уникальную сигнатуру для штрихкодирования», — говорит соавтор исследования Шон Грэм.

Тестирование на 400 образцах наземных растений показало, что двухлокусная система позволила:

• Немедленно определить правильный вид растений в 72% случаев.
• В остальных случаях отнести растение к группе родственных видов (конгенерических).

«Это прагматичный первый шаг. Отдельные исследовательские проекты при необходимости могут дополнить систему третьим локусом ДНК», — отмечает Грэм.

Стандартизация ДНК-штрихкодирования для более чем 400 000 видов растений — ключевой шаг к созданию центральной базы данных для таксономии, сельского хозяйства и охраны природы.

По данным Красного списка МСОП 2008 года, из 12 055 оцененных видов растений 8 457 были признаны находящимися под угрозой исчезновения. Однако оценку прошли только 4% от общего числа видов растений. Оценки доли исчезающих растений варьируются от 13% до 37%.