ДНК-штрихкодирование впервые использовали для идентификации рода Caragana в семействе бобовых

Род Caragana в семействе бобовых имеет важное экологическое и фармакологическое значение. Он играет ключевую роль в экосистеме холодных пустынь по всему азиатскому континенту. Однако точная идентификация таксонов в этом роду была сложной задачей.

В исследовании, опубликованном в Journal of Systematics and Evolution, учёные из Сишуанбаньнаского тропического ботанического сада (XTBG) Китайской академии наук стремились установить стандарт ДНК-штрихкодирования для надёжной идентификации видов Caragana. Это поможет в процедурах контроля качества, особенно для сильно фрагментированных растительных материалов.

Исследователи провели наиболее полный отбор таксонов для этого рода. Используя три аналитических подхода (попарное генетическое расстояние, сходство последовательностей и метод филогенетического дерева), они оценили эффективность четырёх регионов для штрихкодирования: nrITS, trnH-psbA, matK и rbcL.

Они обнаружили, что ядерный регион ITS был наиболее точным и эффективным штрихкодом для различения образцов/видов Caragana. При использовании отдельно или в комбинации с trnH-psbA он показал наивысший уровень дискриминации и может различать виды Caragana.

Неожиданно ранее рекомендованные универсальные штрихкоды для растений rbcL + matK оказались неэффективными идентификаторами для видов Caragana. Поэтому исследователи рекомендуют использовать ITS отдельно или комбинацию двух регионов (trnH-psbA + ITS) в качестве штрихкодов для Caragana.

«Насколько нам известно, настоящее исследование является первой попыткой использования ДНК-штрихкодирования для Caragana и её родственников», — сказала Лю Хунмэй из XTBG.