Молекулярная линейка определяет длину бактериальной иглы

Бактерии сальмонеллы используют наноскопическую иглу для инъекции белков в клетку-мишень, чтобы облегчить инфекцию. Если игла слишком короткая, клетка не заразится. Если слишком длинная — игла сломается. Биологи из Университета Юты выяснили, как одноразовая молекулярная линейка (или рулетка) определяет длину бактериальной иглы, делая её идеальной.

Исследование профессора биологии Келли Хьюза и докторанта Дэниела Ви опубликовано в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.

«Если вы посмотрите на важные патогены — бактерию бубонной чумы, сальмонеллу, шигеллу и фитопатогены, такие как бактериальный ожог, — все они используют иглы, похожие на гиподермические, для инъекции белков, способствующих развитию болезни», — говорит Хьюз.

Учёные обнаружили, что по мере роста бактериальной иглы (инъектосома) молекулярная линейка (скорее, липкая рулетка) секретируется из основания иглы. Она просачивается вверх по трубке иглы, и когда нижний конец линейки достигает нижнего конца иглы, рост иглы останавливается, и она начинает инъецировать белки в клетку-мишень.

«Наша работа показывает, что существует один механизм — молекулярная линейка, — который объясняет, как контролируется длина игл у грамотрицательных бактерий и крючков на жгутиках [шарнирах в пропеллерах, которые бактерии используют для движения] у всех бактерий», — добавляет Хьюз.

Значение открытия

Понимание того, как бактерии определяют длину своих игл, может иметь долгосрочные применения:

  • Разработка новых антибиотиков против сальмонеллы и других патогенных бактерий.
  • Конструирование бактерий, способных инъецировать химиотерапевтические препараты прямо в раковые клетки.
  • Помощь в проектировании машин на наноскопическом или молекулярном уровне.

«То, что мы понимаем о бактериях, может помочь нам создавать наномашины и наноботов», — отмечает Хьюз, подчёркивая, что бактериальные жгутики — «самые сложные наномашины во Вселенной».

Подход, нацеленный на механизм сборки инъектосом, может работать против таких бактерий, как:

  • Сальмонелла (брюшной тиф, пищевое отравление)
  • Шигелла (дизентерия)
  • Yersinia pestis (бубонная чума)
  • Патогенные E. coli
  • Chlamydia trachomatis (ИППП)
  • Многие фитопатогены
  • Pseudomonas aeruginosa (инфекции у ожоговых больных и пациентов с муковисцидозом)

Как работает молекулярная линейка

Бактериальные инъектосомы невероятно малы — от 20 до 100 нанометров в длину. 100 нанометров — это одна тысячная толщины человеческого волоса.

Сборка иглы начинается с основания («белкового пончика»). Затем белки начинают собираться, формируя иглу. Исследование показало, что у сальмонеллы линейка медленно секретируется через канал растущей иглы.

«Как только аминокислоты на нижнем конце линейки проходят через основание иглы, они сообщают бактерии, что игла достаточно длинная, и рост нужно остановить. Они также дают команду игле инъецировать вирулентные белки в клетку-мишень, после чего молекулярная линейка выбрасывается», — объясняет Дэниел Ви.

Методология исследования

Исследование проводилось на штамме Typhimurium Salmonella enterica. Учёные доказали, что молекулярная линейка определяет длину иглы, вставив аминокислоты из генов молекулярной линейки бактерии чумы в гены линейки сальмонеллы, создав линейки семи различных длин.

Генетически модифицированные сальмонеллы с семью длинами линеек выращивали в колбе, их иглы выделяли, а длину измеряли с помощью электронного микроскопа.

Ви обнаружил, что длина линейки точно коррелировала с длиной получившихся игл: каждая добавленная аминокислота в гене линейки делала иглу длиннее на 0.2 нанометра.

Исследование также опровергло другие теории определения длины иглы у сальмонеллы:

  1. Теория «мерного стакана»: утверждала, что чашеобразная структура в основании отправляет порцию компонентов для сборки. Опыт с генетическим удалением этой «чашки» показал, что иглы всё равно вырастали до правильной длины.
  2. Теория «внутреннего стержня»: предполагала, что сборка стержневидной структуры внутри основания определяет остановку роста иглы. Исследование из Юты показало, что компоненты стержня и иглы не производятся одновременно, а конкурируют друг с другом, создавая иллюзию такого контроля.