Новый "атлас" показывает, как антитела атакуют варианты спайк-белка

Исследователи из Brigham and Women's Hospital и их коллеги создали "атлас", который описывает, как 152 различных антитела атакуют ключевую часть "машинерии" SARS-CoV-2 — спайк-белок — по мере его эволюции с 2020 года. Исследование, опубликованное в Cell, выявляет антитела, способные нейтрализовать новые штаммы, и определяет области спайк-белка, ставшие более устойчивыми к атаке.

• Исходный материал: Исследователи изучили антитела, продуцируемые B-клетками памяти 19 пациентов, инфицированных SARS-CoV-2 в марте 2020 года (до появления новых вариантов).
• Метод: Анализировалось связывание этих антител, а также других ранее охарактеризованных, с моделями спайк-белка вариантов B.1.1.7 (Alpha), B.1.351 (Beta) и P.1 (Gamma). Анализ варианта Delta продолжается.
• Ключевой вывод: Сотни изученных антител в основном связываются с семью основными "участками" (footprints) на спайк-белке.
• Динамика при мутациях: Хотя многие антитела "конкурируют" за связывание с одними и теми же областями исходного спайк-белка, в случае новых штаммов некоторые антитела теряют эффективность, а другие становятся широко реагирующими нейтрализаторами.
• Наиболее уязвимые участки: Антитела, связывающиеся с двумя областями — RBD-2 и NTD-1 — были наиболее мощными нейтрализаторами исходных форм вируса.
• Наиболее устойчивый вариант: Спайк-белок варианта B.1.351 (Beta) показал наибольшую способность уклоняться от существующего арсенала антител, "ускользая" от многих антител, связывающихся с RBD-2 и NTD-1.
• Широкий спектр: Некоторые антитела, связывающиеся с областью S2-1, могли распознавать спайк-белки более отдаленно родственных вирусов, таких как MERS, SARS и коронавирусы простуды.

Значение: Данные помогают понять, как вакцины обеспечивают защиту от новых вариантов на уровне антител, и могут помочь в разработке оптимальных бустерных вакцин, направленных на выработку более широко реагирующих антител.