Таксономия вирусов

Согласно современной универсальной системе классификации, для таксономии вирусов условно приняты три основных иерархических уровня:

Внутривидовое разнообразие может обозначаться дополнительными категориями, такими как подвид, тип, вариант или штамм.

Критерии классификации:

  • Семейство. Основным критерием для объединения вирусов в одно семейство считается общность их происхождения.
  • Род. Критерии для выделения родов более разнообразны и часто различаются от одного семейства к другому.
  • Вид. Необходимость таксона «вид» признаётся всеми, однако для большинства родов чёткое разделение на отдельные виды до сих пор не проведено.

Главные таксономические признаки, используемые для классификации вирусов:

  • Тип нуклеиновой кислоты (НК) — РНК или ДНК.
  • Наличие внешней липопротеидной оболочки (суперкапсида) — есть или нет.
  • Форма вирионов — изометрическая (сферическая), палочковидная, пулевидная, сложная (смешанная).
  • Структура генома:
    • Полярность — позитивная (+) или негативная (-) цепь РНК.
    • Организация — непрерывный или фрагментарный (сегментированный) геном.
    • Количество молекул НК — монопартидный (одна), дипартидный (две) или мультипартидный (несколько).

Для разграничения подвидовых таксонов (вариантов, штаммов) дополнительно используют такие признаки, как антигенная структура, круг восприимчивых хозяев, патогенность и другие биологические свойства.

Современный контекст

Современная таксономия вирусов, управляемая Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV), продолжает развиваться. С появлением метагеномики и методов высокопроизводительного секвенирования были открыты тысячи новых вирусов, что привело к пересмотру и расширению системы. Были введены дополнительные ранги выше семейства, такие как порядок (Reovirales, Mononegavirales и др.), а для некоторых групп — подцарство и царство. Ключевым критерием сейчас является филогенетическое родство, устанавливаемое по последовательностям консервативных генов (например, гена РНК-зависимой РНК-полимеразы у РНК-вирусов). Это позволяет строить более естественную, эволюционно обоснованную систему, хотя традиционные морфологические и физико-химические признаки по-прежнему остаются важными диагностическими маркерами.