Свободноживущие микроорганизмы

Свободноживущие микроорганизмы — это виды бактерий, грибов и протистов (протозоа), основным местом обитания которых являются абиогенные среды: почва, вода и мёртвые органические субстраты (например, опавшая листва, древесина).

Сообщества свободноживущих микроорганизмов чрезвычайно многочисленны и разнообразны. Среди них встречаются представители с разными типами метаболизма:

Как правило, эти организмы адаптированы к жизни вне макроорганизмов. При случайном попадании с водой, пищей или воздухом в живые организмы они быстро погибают или удаляются из них. Однако некоторые гетеротрофные виды при определённых условиях могут преодолевать защитные барьеры и вызывать заболевания у растений, животных и человека.

Современный контекст

Современная микробиология и экология рассматривают свободноживущие микроорганизмы как ключевое звено в биогеохимических циклах (круговороте углерода, азота, серы и других элементов). Их роль в разложении органического вещества и поддержании плодородия почв трудно переоценить. Термин «протозоа» (простейшие) в современной таксономии часто заменяется на «протисты», что отражает более сложное эволюционное родство этих эукариотических организмов. Исследования с помощью метагеномики показали, что истинное разнообразие свободноживущих микроорганизмов в природных средах на порядки превышает число культур, выращенных в лаборатории.