Идентификация вирусов

Лабораторный процесс определения систематического положения неизвестного штамма вируса вплоть до вида или варианта.

Методы идентификации

Традиционно процесс включает несколько этапов:

• Выделение вируса из биологического материала (крови, тканей, смывов).
• Культивирование на чувствительных клеточных культурах, куриных эмбрионах или лабораторных животных для накопления вирусных частиц.
• Серологическая идентификация с использованием специфических антител для определения антигенных свойств вируса (например, реакция нейтрализации, иммунофлуоресценция).
• Изучение биологических свойств: определение спектра поражаемых хозяев, типа цитопатического действия на клетках, устойчивости к физико-химическим факторам.

Современный контекст

С развитием молекулярной биологии классические методы всё чаще дополняются или заменяются геномными технологиями, которые позволяют проводить идентификацию быстрее и точнее:

• ПЦР (полимеразная цепная реакция) и её разновидности (ПЦР в реальном времени, ОТ-ПЦР для РНК-вирусов) для обнаружения специфических фрагментов вирусного генома.
• Секвенирование нового поколения (NGS) позволяет не только идентифицировать известный вирус, но и обнаружить новые, ранее неизвестные патогены, а также проводить филогенетический анализ для отслеживания происхождения и путей распространения штаммов.
• Метод масс-спектрометрии (MALDI-TOF) для быстрой идентификации вирусов по белковому профилю.

Современная идентификация часто представляет собой комплексный подход, сочетающий серологические, молекулярные и биоинформатические методы.