Виртуальная реальность в борьбе с болезнями

Исследователи из Лундского университета (Швеция) революционизировали анализ данных об активности генов в отдельных клетках, используя технологию 3D-видеоигр. Работа опубликована в журнале iScience.

Современные методы секвенирования ДНК и РНК позволяют изучать отдельные клетки ткани, генерируя огромные массивы данных. Например, для сравнения раковых и нормальных клеток необходимо проанализировать тысячи клеток.

Для визуализации данных каждая клетка математически позиционируется в трёхмерном пространстве, создавая «карту» клеток и их взаимосвязей. Навигация по таким картам на обычном компьютере затруднена.

Команда разработала программное обеспечение CellexalVR — среду виртуальной реальности, где исследователи могут интуитивно изучать все данные в одном месте. В VR отображаются 3D-карты клеток, рассчитанные на основе активности генов, что позволяет чётко видеть, какие гены активны при формировании определённых типов клеток.

Используя VR-шлем и контроллеры, учёные могут:

• Исследовать целую вселенную популяций клеток.
• Точнее определять взаимосвязи между клетками.
• Выделять интересующие клетки для анализа простыми жестами, как физические объекты.

Пространство VR позволяет размещать несколько клеточных карт в одной «комнате» для сравнения, что сложно на обычном экране. Исследователи из разных географических точек могут совместно анализировать данные в виртуальном мире.

«Виртуальная реальность — это быстро развивающаяся область с огромным потенциалом для учёных, которым необходим интерактивный и совместный способ работы с большими данными», — заключает Шамит Сонежи, исследователь в области вычислительной биологии.