Исследователи изучат положительный генетический вклад вирусов

Исследователи из Университета Делавэра и Делавэрского института биотехнологий изучат положительный генетический вклад вирусов в жизнь на Земле благодаря гранту от Инициативы по морской микробиологии Фонда Гордона и Бетти Мур.

Двухлетний грант в размере $550,000 был присужден профессору К. Эрику Воммаку и доценту-исследователю Шону Полсону. Грант поддержит развертывание вычислительной инфраструктуры для анализа генетических данных вирусов из образцов окружающей среды — ресурса VIROME.

Проект выполняется в сотрудничестве с исследователями из Калифорнийского университета в Сан-Диего, участвующими в проекте CAMERA.

Исследование Воммака сосредоточено на положительном генетическом вкладе вирусов — аспекте, который еще не был широко изучен. Ученые признают, что вирусы содержат, возможно, самую большую коллекцию неизвестных генов на Земле.

Изучая глубоководные гидротермальные источники, загрязненные ураном грунтовые воды, воду Чесапикского залива и другие "рассадники" вирусов, команда обнаружила, что вирусы содержат совершенно новые версии генов с известными функциями.

«Мы действительно не ценим генетический вклад, который вирусы вносят в жизнь, кроме негативного», — говорит Воммак.

Например, в некоторых образцах вирусов были найдены гены, критически важные для сворачивания белков. Неправильное сворачивание белка является компонентом причины некоторых заболеваний, поэтому это знание может быть очень важным для понимания процессов вирусной инфекции.

Данные, полученные в рамках гранта, помогут ученым больше узнать о генетическом составе вирусов. Созданная база данных и веб-интерфейс помогают "расставить знаки препинания" в данных последовательности ДНК, превращая сырую геномную информацию в полезную генетическую информацию.

Веб-приложение VIROME и библиотеки секвенирования уже доступны для бесплатного использования онлайн.