Исследование эволюционной истории вирусов для прогнозирования вспышек

Изучение эволюционной истории вирусов, в частности ортогантавирусов, может помочь в борьбе с будущими вспышками заболеваний у людей.

Исследователь Шуйлер Липхардт и его команда опубликовали работу "Complex History of Codiversification and Host Switching of a Newfound Soricid-Borne Orthohantavirus in North America". В ней анализируется эволюционная история гантавирусов.

Методология: Исследование использует филогенетику для реконструкции эволюционных взаимоотношений между вирусами и их хозяевами — млекопитающими, такими как летучие мыши, землеройки (soricid) и кроты. Учёные сравнивают "деревья родства" вируса и хозяина, чтобы определить:

  • Специфичен ли вирус к одному виду хозяина.
  • Или он легко "перепрыгивает" между видами (host switching), адаптируясь к новым носителям.

Ключевой объект: Работа фокусируется на конкретном штамме — вирусе Джемес-Спрингс (Jemez Springs virus) — и его распространении в системе с несколькими видами-хозяевами.

Важность для прогнозирования: Понимание прошлых паттернов распространения вируса помогает предсказать его поведение в будущем. Изменение ареалов млекопитающих-хозяев из-за изменения климата позволяет прогнозировать потенциальные "горячие точки" возникновения болезней.

Пример связи с климатом: Вспышка хантавирусного кардиопульмонального синдрома (HPS) в районе Фо́р-Корнерс в начале 1990-х годов, вызванная вирусом Син Номбре (Sin Nombre virus), тесно связана с циклами Эль-Ниньо. Влажные циклы приводят к взрывному росту популяции оленьих хомячков (переносчиков), увеличивая риск заражения человека.

Коллаборация: Исследование стало результатом масштабного сотрудничества нескольких институтов. Образцы, собранные маммологами по всей западной части Северной Америки, были архивированы в музеях естественной истории, включая Музей юго-западной биологии (UNM).

Терминологическое уточнение: В связи с новыми данными о родственных связях гантавирусов была проведена реклассификация:

  • Вирусы, ассоциированные с летучими мышами, теперь называются "мобатвирусы" (mobatviruses) или "лоанвирусы" (loanviruses).
  • Все гантавирусы, вызывающие заболевания у людей, теперь классифицируются как ортогантавирусы (orthohantaviruses).