Исследователи обнаружили вирусные малые РНК в клетках комаров
Ученые из Медицинской школы Бостонского университета (BUSM) представили новый геномный ресурс, детализирующий транскриптомы малых РНК (экспрессию генов) четырех биомедицински значимых видов комаров.
Это первое исследование, предоставляющее платформу для сравнения характеристик этих малых РНК между четырьмя видами комаров и наиболее широко используемым в генетических экспериментах насекомым — плодовой мушкой Drosophila. В отличие от предыдущих работ, изучавших каждый вид отдельно, данное исследование впервые позволяет проводить сравнения между всеми четырьмя видами.
Исследователи получили культуры клеток и диссектированные образцы видов комаров Anopheles gambiae, Culex quinquefasciatus, Aedes aegypti и Aedes albopictus. Они экстрагировали и очистили молекулы малых РНК, создали библиотеки для высокопроизводительного секвенирования и разработали специальную биоинформатическую платформу для тщательного геномного анализа этих малых РНК. Весь анализ представлен в общедоступной базе данных: laulab.bu.edu/msrg/.
Четыре вида комаров оказывают глобальное влияние на здоровье человека. Anopheles — основной переносчик паразита, вызывающего малярию, но не известен как переносчик многих вирусов. Напротив, комары Culex и Aedes хорошо известны как переносчики вирусов между людьми при укусах. Причины таких межвидовых различий в способности распространять вирусы остаются неизвестными.
По мнению исследователей, эта работа позволит проводить более качественные биохимические исследования в клетках комаров. Все данные анализа доступны в открытой базе.
Результаты опубликованы в журнале Genome Research.
