Генетическая эволюция вируса Зика

Анализ, сравнивающий индивидуальные различия между более чем 40 штаммами вируса Зика (30 выделенных от людей, 10 от комаров и 1 от обезьян), выявил значительные изменения в аминокислотных и нуклеотидных последовательностях за последние полвека. Данные, опубликованные 15 апреля в Cell Host & Microbe, подтверждают сильное расхождение между азиатской и африканской линиями, а также между изолятами вируса от человека и комара. Это поможет исследователям понять, как относительно неизвестный патоген привел к текущей вспышке.

Исследование, проведенное учеными из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе и Китайской академии медицинских наук в Пекине, дополняет другие анализы вирусных последовательностей, проведенные за последние два месяца, новыми крупномасштабными и структурными сравнениями. Ключевые выводы:

• Все современные человеческие штаммы вируса Зика имеют более сходную последовательность со штаммом Малайзия/1966, чем со штаммом Нигерия/1968. Это указывает, что штаммы последней вспышки у людей произошли от азиатской линии.
• Все человеческие штаммы, идентифицированные в эпидемии 2015-2016 гг., по-видимому, более тесно связаны со штаммом Французская Полинезия/2013, чем со штаммом Микронезия/2007. Это говорит о том, что два варианта эволюционировали от общего предка.
• Белок prM (прекурсор предшественника мембраны) вируса Зика показал наибольший процент вариабельности между азиатскими человеческими и африканскими комариными подтипами. Моделирование предполагает, что часть этой вариабельности вносит вклад в значительное структурное изменение.

«Мы полагаем, что эти изменения могут, по крайней мере частично, объяснить, почему вирус продемонстрировал способность к экспоненциальному распространению в популяции людей в Америке», — говорит старший автор исследования Генхонг Ченг. — «Эти изменения могли позволить вирусу реплицироваться более эффективно, проникать в новые ткани, обеспечивающие защитные ниши для размножения вируса, или уклоняться от иммунной системы, приводя к персистенции вируса. Разумеется, все эти гипотезы необходимо будет проверить в экспериментальных моделях».

Будущая работа по секвенированию, вероятно, будет сосредоточена на понимании штамма Зика, вызвавшего эпидемию 2015-2016 гг., который еще не был выделен от комара. Группа Ченга и другие также начнут выяснять структуру вирусных белков, что может помочь в разработке лекарств и вакцин. «Мы надеемся, что наша работа предоставит прочную основу, которая поможет научному сообществу ускорить исследования вируса Зика», — отмечает он.