Генетический анализ: вирус синего языка в Нидерландах уникален

Вирус синего языка (bluetongue virus, BTV) быстро распространяется в Нидерландах. Благодаря использованию новых методов, включая полногеномное секвенирование, быстро стало ясно, что голландский вирус представляет собой иной вариант по сравнению с предыдущими вспышками.

«Также выяснилось, что циркулирующий в Нидерландах вариант вируса, серотип 3, генетически не идентичен вирусу синего языка серотипа 3, который ранее находили, например, на Сицилии», — заявил исследователь Мелле Холверда из Wageningen Bioveterinary Research (WBVR).

Статья на эту тему опубликована на сервере препринтов bioRxiv.

Идентификация серотипа

После более чем десятилетнего перерыва синий язык вернулся в Нидерланды. В предыдущей вспышке 2006 года страна пострадала от вируса серотипа 8 (BTV-8). В течение недели после того, как в сентябре 2023 года у первых овец с клиническими признаками был диагностирован синий язык, полная геномная последовательность текущего вируса была определена с помощью полногеномного секвенирования.

Сразу стало ясно, что в текущей вспышке задействован другой серотип по сравнению с циркулировавшим в 2006 году.

«Наше исследование показало, что нынешняя вспышка была вызвана серотипом 3. Этот результат также был подтвержден Европейской референс-лабораторией в Мадриде через несколько дней после нашего анализа», — говорит Мелле Холверда, руководитель Национальной референс-лаборатории по вирусным болезням животных, передающимся переносчиками.

Географическое происхождение

Серотип 3 — это вариант вируса синего языка, который также обнаруживали на Сицилии, в Израиле и некоторых частях Африки. Чтобы выяснить, может ли вирус, присутствующий в Нидерландах, происходить из этих регионов, голландский вирус был исследован дальше.

«Мы сравнили генетический состав голландского вируса с аналогичными вирусами BTV-3 из Италии, Израиля и Южной Африки», — говорит Холверда.

На основе этого анализа исследовательская группа пришла к выводу, что, хотя все изоляты вируса были классифицированы как серотип 3, между ними достаточно различий.

«Основываясь на этом анализе, мы не можем на 100% быть уверены в географическом происхождении вируса, поэтому он не обязательно происходит из Сицилии, Израиля или Африки», — объясняют они.

Много неясностей

Доступность новых методов, таких как полногеномное секвенирование, быстро дала ответ на вопрос, какой серотип вируса синего языка циркулирует в Нидерландах. Однако дополнительные исследования с использованием этих новых методов также оставляют много вопросов без ответа.

«Мы знаем, что имеем дело с серотипом 3 и что это уникальный вариант этого серотипа. Однако остается неясным, как этот вирус был занесен в нашу страну и откуда он произошел».

Известно, что вирус синего языка передается мокрецами — очень мелкими мухами.

«Фактом является то, что BTV-3 распространяется в Нидерландах, что показывает, что местные голландские мокрецы являются компетентными переносчиками и обеспечивают дальнейшую передачу. Какой именно вид мокрецов ответственен за текущее распространение вируса синего языка, на данный момент все еще неизвестно», — сказал Холверда.