Уэльс стал первой страной с полной ДНК-баркодировкой местных цветковых растений

Исследователь из Университета Западной Англии (UWE Bristol) сыграл ключевую роль в проекте, который впервые создал ДНК-баркоды для всех местных цветковых растений и хвойных Уэльса.

Доктор Джоэль Алленгейм участвовал в разработке проекта, результаты которого опубликованы в журнале PLoS ONE и уже привлекли внимание более 40 000 исследователей.

Как работает ДНК-баркодирование?

• Метод позволяет идентифицировать любой вид растения по мельчайшему фрагменту: пыльце, семени, корню или образцу из почвы, воды или воздуха.
• Для растений в качестве стандартных штрихкодов используют два гена: rbcL и matK. Они достаточно различаются между видами, но стабильны внутри одного вида.

Результаты проекта Barcode Wales

За четыре года создана референсная база данных для 1143 местных видов Уэльса:

• Собрано 3304 баркода для гена rbcL и 2419 для matK.
• 98% флоры Уэльса имеют баркод для rbcL, 90% — для обоих генов (rbcL и matK).
• Эффективность идентификации: до 75% видов в масштабах всей страны, в среднем 82% — на площади 10 км² и 93% — на площади 2 км².

Все ДНК-баркоды находятся в свободном доступе в Barcode of Life Database (BOLD).

Применение и перспективы

Созданная база данных открывает возможности для исследований в области биоразнообразия, охраны природы и здоровья человека. Уже ведутся проекты по:

• Баркодированию меда для поиска новых лекарств.
• Изучению роли журчалок в опылении.
• Планируется баркодирование всей флоры Великобритании.

Проект возглавляли доктор Наташа де Вере из Национального ботанического сада Уэльса и доктор Тим Рич из Национального музея Уэльса.