Расшифровка транскриптома тритона проливает свет на регенерацию тканей

Учёные идентифицировали семейства белков, экспрессируемые во время регенерации тканей у тритонов, что закладывает основу для исследований, направленных на выяснение, используются ли для этой цели особые наборы генов.

Транскриптом — карта всех молекул РНК — тритона Notophthalmus viridescens опубликован в открытом журнале Genome Biology издательства BioMed Central. N. viridescens является полезной моделью в регенеративной медицине благодаря своей способности к регенерации тканей, и эти данные дают представление о механизмах, лежащих в основе этого процесса.

N. viridescens, обыкновенный тритон, родом из Северной Америки, является хвостатым земноводным. Геномы тритонов и саламандр огромны и в настоящее время слишком велики для секвенирования, но их способность регенерировать целые конечности, а также части центральной нервной системы, на протяжении более 200 лет очаровывает учёных. Томас Браун, Тило Борхардт из институтов Макса Планка, Панайотис Цонис из Университета Дейтона и их коллеги секвенировали коллекцию здоровых и регенерированных тканей тритона и объединили их в один комплексный транскриптом.

Их анализ выявил 826 белков, специфичных для хвостатых земноводных, и несколько вновь идентифицированных белков, которые, по их мнению, могут играть важную роль в уникальном для этой группы процессе регенерации. Данные также описывают гены, которые появляются только в регенерирующих, но не в неповреждённых тканях, что представляет интерес для регенеративной медицины.

Транскриптом не является полным, но служит матрицей для дальнейших анализов. Авторы считают, что их находки представляют лишь верхушку айсберга: «Наши данные закладывают основу для механистических экспериментов, чтобы ответить на вопрос, используют ли хвостатые земноводные собственные наборы генов для регенерации тканей». Они добавляют: «Вновь установленный de novo транскриптом [...] станет незаменимым ресурсом для лучшего понимания регенеративных процессов у тритонов и облегчит идентификацию молекул [...], которые контролируют этот увлекательный процесс».