Исследователи секвенировали геном свиньи

Международный консорциум представил первый черновой вариант генома домашней свиньи. Это достижение позволит получить новые данные в сельском хозяйстве, медицине, охране природы и эволюционной биологии.

Красноволосый хряк породы дюрок с фермы Университета Иллинойса пополнил список одомашненных животных с расшифрованным геномом. Исследователи объявили об этом достижении в понедельник, 2 ноября, на встрече в Институте Сэнгера Wellcome Trust в Хинкстоне, Англия.

Значение проекта

"Свинья — уникальное животное, важное для производства продуктов питания и используемое в качестве модели для изучения болезней человека", — заявил Ларри Шук, профессор биомедицинских наук Университета Иллинойса и руководитель проекта. По его словам, поскольку дикие предки свиней до сих пор существуют, это "действительно интересное животное для изучения геномных эффектов одомашнивания".

Порода дюрок — одна из пяти основных пород, используемых в мировом свиноводстве, и одна из примерно 200 пород домашних свиней. Существует также множество разновидностей дикого кабана, который, как считается, произошел в Евразии.

Организация и финансирование

В проекте участвовала международная команда ученых и центров секвенирования. Национальный институт продовольствия и сельского хозяйства Министерства сельского хозяйства США (USDA NIFA) выделил первоначальное финансирование в размере 10 миллионов долларов, поставив условия:

• Это должен быть единственный в мире проект по секвенированию генома свиньи.
• Он должен быть государственно-частным партнерством и глобальным совместным проектом.
• Участники должны предоставить значительную финансовую или натуральную поддержку.

Общая стоимость проекта составила около 24,3 миллиона долларов. Дополнительную поддержку оказали Служба сельскохозяйственных исследований Министерства сельского хозяйства США (USDA ARS) и многие другие американские, азиатские и европейские спонсоры. Еще одним требованием было публичное размещение всех результатов без каких-либо коммерческих интересов.

Научные перспективы

Черновой вариант последовательности, который готов примерно на 98%, позволит исследователям:

• Выявлять гены, полезные для производства свинины или участвующие в иммунитете и других важных физиологических процессах.
• Усовершенствовать методы селекции.
• Получить представление о болезнях, поражающих свиней (а иногда и людей).
• Помочь в сохранении глобального наследия редких, исчезающих и диких свиней.

Проект также важен для изучения здоровья человека, поскольку физиология, поведение и пищевые потребности свиней очень похожи на человеческие.

Реакция научного сообщества

• Стив Каппес (USDA ARS): "Мы ожидаем, что это ускорит генетическое улучшение свиней, подобно тому, как последовательность генома крупного рогатого скота повлияла на генетический прогресс в молочной промышленности".
• Профессор Алан Арчибальд (Институт Рослина, Эдинбургский университет): "Когда мы запускали международный проект по картированию генов свиньи почти 20 лет назад, мало кто из нас думал, что секвенирование генома свиньи будет достижимо и доступно".
• Профессор Аллан Брэдли (Институт Сэнгера, выполнивший большую часть секвенирования): "Эта последовательность — ценный инструмент для лучшего понимания болезней человека, особенно для облегчения сердечно-сосудистых, легочных, желудочно-кишечных и иммунологических исследований".
• Ларри Шук: "Это всего лишь конец начала процесса. Теперь мы только начинаем получать возможность ответить на множество вопросов о свинье".

Источник: Университет Иллинойса в Урбане-Шампейне.