Необходимость стандартов для контроля качества клеточных линий

Клеточные линии — клонированные клетки, способные к неограниченному делению в культуре, — являются основой биомедицинских исследований. Они используются для изучения биологии здоровья и болезней и тестирования потенциальных методов лечения. Однако эти, казалось бы, незыблемые столпы бионауки и биотехнологии часто оказываются ненадежными из-за использования ошибочного исходного материала: перепутанных или перекрестно-загрязненных клеточных линий.

Ученые из Национального института стандартов и технологий США (NIST) в статье в открытом журнале PLOS Biology призывают к «совместным действиям» для создания «исчерпывающего набора инструментов для обеспечения качества клеточных линий», используемых в начале каждого исследования.

Не менее важно, по их мнению, более широкое использование уже существующих инструментов. Авторы указывают на Американский национальный стандарт аутентификации клеточных линий человека (ASN-0002 2011), который позволяет выявлять перепутывание и загрязнение линий до начала исследований рака или других работ с человеческими клетками. Несмотря на то, что аутентификация клеточных линий становится все более важным приоритетом для финансирующих организаций и научных изданий, этот четырехлетний стандарт не получил широкого распространения.

Проблема и масштабы

• Загрязнение и ошибочная идентификация клеточных линий могут подорвать результаты исследований, стимулировать дополнительные сомнительные исследования и привести к растрате средств.
• Согласно экономическому анализу 2015 года, эта проблема составляет значительную часть от примерно $28 млрд, ежегодно тратящихся в одних только США на невоспроизводимые доклинические исследования.

Существующие решения и их ограничения

• Критическая важность аутентификации клеточных линий широко признана. NIH, другие агентства и научные журналы ввели требования к отчетности об аутентификации и чистоте клеточных линий.
• Однако, согласно отчету Global Biological Standards Institute за 2015 год, 52% исследователей в области наук о жизни никогда не проверяют свои клеточные линии.
• Стандарт ASN-0002, основанный на методе коротких тандемных повторов (ДНК-«отпечатков пальцев») из криминалистики, по мнению авторов, является «очень тщательным и полезным». Ограниченное его использование может быть связано с «недостаточной осведомленностью».

Пути вперед

1. Внедрение существующего стандарта: Авторы рекомендуют использовать стандарт ASN-0002 в программах обучения и образования, чему могут поспособствовать требования финансирующих организаций и издателей.
2. Разработка новых стандартов: Необходимы сопоставимые стандарты аутентификации для мышиных, крысиных и других важных нечеловеческих клеточных линий, используемых в исследованиях и биопроизводстве.
3. Использование консенсусного подхода: Авторы выступают за использование открытых процессов установления стандартов на основе консенсуса (как для стандарта по человеческим клеткам) для решения этих задач и использования новых возможностей, возникающих с коммерциализацией технологий секвенирования генома.

«Консенсусные стандарты, созданные в ходе тщательного, открытого и официального процесса, являются неотъемлемой частью успеха этого начинания. Стандарты помогают обеспечить возможность обмена данными и могут служить основой для принятия решений и соблюдения требований».