Использование уникальных идентификаторов снижает неправильное применение клеточных линий в исследованиях

Использование уникальных идентификаторов научных ресурсов (Research Resource Identifiers, RRIDs) помогает снизить неправильное применение клеточных линий в биомедицинских исследованиях, согласно исследованию, опубликованному в eLife.

Проблема воспроизводимости

Клеточные линии широко используются в биологических науках. Их способность к неограниченному делению позволяет, в теории, точно воспроизводить предыдущие исследования. Однако ошибки в маркировке или обращении могут привести к неправильной идентификации, контаминации и распространению проблемных клеточных линий, что влияет на достоверность научных данных.

Роль RRIDs и баз данных

RRIDs — это уникальные идентификаторы, которые можно включать в раздел «Методы» научной статьи для точного определения использованных клеточных линий, антител, трансгенных организмов или программного обеспечения.

• Идентификаторы для клеточных линий создаются авторитетной базой данных Cellosaurus — наиболее полным ресурсом знаний о клеточных линиях.
• RRIDs могут предупредить исследователей о ресурсах, которые помечают проблемные линии, такие как реестр неправильно идентифицированных клеточных линий Международного комитета по аутентификации клеточных линий (ICLAC).

Результаты анализа публикаций

Команда использовала алгоритм обработки естественного языка для анализа разделов методов около двух миллионов статей в PubMed Central.

• Было выявлено 305 161 уникальное название клеточных линий в 150 459 статьях. По оценкам, 8,6% из них находились в списке проблемных линий.
• В то же время только 3,3% клеточных линий в 634 статьях, которые включали RRIDs, были в проблемном списке.

Это говорит о том, что использование RRIDs связано с более низким заявленным использованием проблемных клеточных линий.

Важные оговорки

Авторы предупреждают, что использование линии из проблемного списка не означает автоматически её неправильное применение.

• Список включает, например, линии, которым был приписан неверный тип рака, но которые всё ещё могут быть корректно использованы, если исследователям известна их истинная идентичность.
• Важно оценивать конкретные доказательства и контекст.

Вывод

Включение RRIDs в публикации, вероятно, улучшает осведомлённость исследователей и способствует более корректному отчёту об использованных материалах, что в перспективе поможет усилиям по повышению воспроизводимости научных работ.