Новый метод выявил неожиданные функции snoRNA в разных типах клеток

Исследователи из Чикагского университета разработали новый подход для идентификации клеточных РНК-мишеней малых ядрышковых РНК (snoRNA). Они обнаружили тысячи ранее неизвестных мишеней для snoRNA в клетках человека и тканях мозга мыши, включая многие, которые выполняют функции, отличные от направляющей модификации рРНК.

Работа "SnoRNA-facilitated protein secretion revealed by transcriptome-wide snoRNA target identification" была опубликована в ноябре 2024 года в журнале Cell.

Ключевые открытия:

• В человеческом геноме известно более 1000 генов, кодирующих snoRNA, но мишени были известны лишь для ~300 из них. Новый метод snoKARR-seq позволил связать snoRNA с их РНК-мишенями на уровне транскриптома.
• Большинство вновь обнаруженных мишеней snoRNA не совпадают с известными сайтами модификации РНК, что указывает на гораздо более широкую функцию snoRNA в клетках.
• Одно из неожиданных открытий: snoRNA SNORA73 взаимодействует с мРНК, кодирующими секретируемые и мембранные белки.

SNORA73 как "молекулярный клей" для секреции белка

• Исследователи выяснили, что SNORA73 действует как "молекулярный клей" между мРНК и аппаратом синтеза белка, облегчая процесс секреции.
• Эксперименты с репортерным белком GFP показали, что инженерия взаимодействия с SNORA73 может увеличить секрецию белка на 30–50% по сравнению с контролем.
• Это открывает возможность манипулировать секрецией заданного белка, что может быть полезно для разработки терапевтических средств (например, при заболеваниях, связанных с дефицитом секретируемых белков).

Перспективы

По словам соавторов работы Чуань Хэ и Тао Пан, технология синтеза и доставки snoRNA в нужные места пока не готова, но эта задача решаема. Поскольку snoRNA специфичны для типов клеток, они могут иметь гораздо более разнообразные функции и терапевтические возможности в нейронах, стволовых или раковых клетках.