Международный консорциум объявил о первом полном секвенировании генома груши

Международный консорциум по геному груши, в который входят семь университетов и институтов, завершил первое в мире полное секвенирование генома груши. Ранний доступ к геномным данным груши теперь доступен онлайн. В международную команду вошли исследователи из Нанкинского сельскохозяйственного университета, BGI, Чжэцзянской академии сельскохозяйственных наук, Университета Иллинойса в Урбане-Шампейне, Университета Джорджии, Университета Гавайев и Университета Тохоку.

Груша (Pyrus spp.) — одно из основных и древнейших культивируемых плодовых деревьев умеренных регионов, вероятно, возникшее в третичный период (65 миллионов лет назад) на юго-западе Китая. Она генетически разнообразна: в мире существует более 5000 сортов и образцов, которые можно разделить на две основные группы — европейские ("западные") и азиатские ("восточные") груши.

С момента начала проекта по секвенированию генома груши в апреле 2010 года консорциум приложил большие усилия для de novo секвенирования, сборки и аннотирования. Совместная работа привела к созданию высококачественного чернового варианта диплоидной геномной последовательности для коммерчески важного азиатского сорта "Сули" (P. bretschneideri Rehd. cv. Dangshansuli). Было собрано 97,1% от расчетного полного размера генома. Эти собранные скаффолды были выровнены и ориентированы на соответствующие 17 хромосом с использованием высокоплотной генетической карты.

Профессор Шаолин Чжан, главный научный руководитель проекта в Нанкинском сельскохозяйственном университете, заявил: "Полное секвенирование генома груши закладывает прочную научную основу для изучения сложных генетических характеристик плодового дерева, таких как ключевые гены, связанные со вкусом, цветом, хранением, устойчивостью к болезням и вредителям, а также с повышением урожайности. Более того, геномная последовательность представляет собой бесценный новый ресурс для изучения эволюционной истории груши".

Профессор Цзюнь Ван, исполнительный директор BGI, сказал: "Завершение секвенирования генома — это важный шаг к пониманию важных экономических признаков груши. Мы прилагаем постоянные усилия для расшифровки геномов растений и животных, которые играют ключевую экономическую роль или считаются ценными источниками пищи, а также исчезающих видов, имеющих эволюционное или научное значение. Мы хотели бы углубить геномные исследования через совместные проекты с исследователями по всему миру для лучшего понимания генетической основы растений и животных и стимулирования дальнейшего развития современного сельского хозяйства".