Обнаружена мишень в РНК для подавления воспаления

Исследователи из UC Santa Cruz обнаружили в человеческой РНК пептид, регулирующий воспаление. Это открытие может указать новый путь для лечения таких заболеваний, как артрит и волчанка. Команда использовала метод скрининга на основе инструмента редактирования генов CRISPR, чтобы пролить свет на одну из больших загадок нашей РНК — молекулы, ответственной за выполнение генетической информации из ДНК.

Этот пептид происходит из длинной некодирующей РНК (lncRNA) под названием LOUP. Геном человека кодирует более 20 000 lncRNA, что делает их самой большой группой генов. Однако учёные мало знают об их функциях, поэтому lncRNA иногда называют "тёмной материей генома".

Исследование, опубликованное 23 мая в Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), представляет новую стратегию высокопроизводительного скрининга для быстрой идентификации функциональных lncRNA в иммунных клетках. Подход pooled-screen позволяет изучать тысячи генов в одном эксперименте, что намного эффективнее традиционных методов, фокусирующихся на одном гене.

Работу возглавила иммунолог Сьюзан Карпентер. Её лаборатория изучает, какие гены lncRNA участвуют в регуляции воспаления.

Для этого учёные исследовали lncRNA в моноцитах — типе белых кровяных телец. Они использовали модификацию технологии CRISPR/Cas9, называемую CRISPR ингибированием (CRISPRi), чтобы подавить транскрипцию генов и выяснить, какие lncRNA моноцитов влияют на их дифференцировку в макрофаги — другой критически важный для иммунного ответа тип клеток.

Кроме того, с помощью CRISPRi был проведён скрининг lncRNA макрофагов на предмет участия в воспалении. Неожиданно была обнаружена многофункциональная область, которая может работать как РНК, а также содержит ранее неизвестный пептид, регулирующий воспаление.

Понимание того, что этот конкретный пептид регулирует воспаление, даёт разработчикам лекарств новую мишень. Цель — создать малую молекулу для блокирования именно этого молекулярного взаимодействия, чтобы подавить нежелательный ответ.

"Мы ещё далеки от нацеливания на эти пути с таким уровнем точности, но это определённо цель. Сейчас наблюдается большой интерес к РНК-терапии", — пояснила Карпентер.