Новый протокол для RNA-seq и метаболомики: эффективная экстракция с сохранением целостности данных

Ученые Института Ван Андела разработали новый протокол экстракции для анализа RNA-seq и метаболомики, который дает более полную картину клеточной активности, чем каждая из методик по отдельности.

Протокол использует упрощенную экстракцию из единого образца, что снижает вариабельность, повышает эффективность, сохраняет достоверность данных и позволяет максимально использовать ценные биологические образцы.

Достоинства нового метода:

• Эффективность: Один процесс экстракции вместо двух.
• Сохранение данных: Нет потери информации по сравнению со стандартным подходом.
• Экономия ресурсов: Экономит время и ценные образцы, особенно важные для редких типов тканей.

Ранее ученым приходилось проводить две отдельные экстракции — одну для RNA-seq, другую для метаболомики. Такой подход требовал нескольких образцов или разделения одного образца на части, что увеличивало вариабельность и могло влиять на интерпретацию данных. Кроме того, стандартный процесс разрушает образец, не позволяя проводить дальнейший анализ.

Валидация протокола показала, что новый метод сохраняет качество данных по сравнению со стандартной экстракцией.

Протокол опубликован в журнале RNA Biology. Разработка открывает путь к созданию единого конвейера экстракции для RNA-seq, метаболомики, протеомики, транскриптомики и других омикс-подходов.