Оценка распространения редких эндемичных и родственных инвазивных видов гигантских саламандр
Исследовательской группе удалось определить распространение японской гигантской саламандры (Andrias japonicus), памятника природы Японии, и родственного инвазивного вида — китайской гигантской саламандры (Andrias davidianus). Команда получила эту информацию из ДНК саламандр, естественным образом присутствующей в речной воде (экологическая ДНК). Результаты исследования были опубликованы онлайн в британском журнале Journal of Applied Ecology 13 февраля 2015 года.
Основные положения исследования
- Для определения распространения видов гигантских саламандр требуется всего четыре литра речной воды.
- Это первое в Японии исследование, охватившее широкий географический регион непрерывно с использованием метода анализа экологической ДНК.
- Удалось отличить ДНК японской гигантской саламандры от ДНК близкородственного инвазивного вида — китайской гигантской саламандры.
- Запланированы дальнейшие исследования в других частях страны.
Методология
Группа под руководством доцента Минамото сфокусировалась на анализе ДНК в воде (речной или озёрной), происходящей из кусочков кожи и выделений рыб и амфибий. Они разработали метод обнаружения и амплификации этой ДНК с высокой специфичностью с помощью ПЦР в реальном времени (real-time PCR). Метод позволяет определять распространение водных организмов.
Применение и результаты
Метод был успешно применён для оценки распространения японской гигантской саламандры и китайской гигантской саламандры. Группа провела четыре отбора проб воды в 37 точках по всему бассейну реки Кацура в префектуре Киото в период с 2012 по 2013 год. В четырёх литрах воды, отобранных в каждой точке, пытались обнаружить ДНК обоих видов. Полученные результаты тесно коррелировали с данными прошлых исследований с отловом особей.
Это первое исследование, результаты которого, основанные на обширном и непрерывном использовании метода экологической ДНК, были опубликованы. Такой подход может быть полезен для изучения редких ночных видов, которых сложно исследовать методами отлова.