Новое ПО помогает селекционерам выводить лучшие сорта

Исследователи из Корнеллского университета, участвующие в Восточном проекте по брокколи, разработали статистический метод для стандартизации оценки брокколи, чтобы сделать решения в селекции растений более последовательными и эффективными.

Группа учёных — аспирант Закари Станселл, профессор садоводства Томас Бьёркман и Дениз Акдемир — выпустила RateRvaR, новое программное обеспечение на основе этого метода. RateRvaR является бесплатным, с открытым исходным кодом, простым в использовании и применимым для селекционеров любых овощей, деревьев или цветов с субъективными признаками.

Как работает ПО:

• Селекционеры выбирают признаки и просят нескольких людей провести одинаковую оценку.
• Программа анализирует данные, чтобы определить, какие признаки более или менее важны для прогнозирования общего качества.
• Она расставляет приоритеты для признаков, которые легче оценить объективно (например, размер или цвет), и выявляет нерелевантные признаки, что позволяет собирать меньше данных без потери точности.

Решаемые проблемы:

• Субъективность оценки: Разные люди используют разные критерии (симметрия, цвет), и неясно, насколько эти предпочтения значимы для общего качества.
• Логистика: Селекционерам сложно лично оценивать растения, высаженные в разных климатических зонах и созревающие в разное время.
• Эффективность: Метод помогает определить, на каких признаках стоит сконцентрировать ограниченные время и ресурсы для максимального прогресса.

Пример из проекта:

В рамках Восточного проекта по брокколи ежегодно выращивают не менее 40 сортов, чтобы найти подходящие для климата от Флориды зимой до Мэна летом. Анализ с помощью RateRvaR показал, что форма кочана действительно важна, а размер бутонов — менее важен, что помогло скорректировать приоритеты в селекционной работе.

Цитата исследователя:

«Этот подход может стандартизировать оценки, сделать их быстрее и эффективнее, а также выявить индивидуальные предубеждения в том, как человек воспринимает конкретный сорт растения», — говорит Закари Станселл.