Завершён каталог генома плодовой мушки
Учёные, ищущие "святой Грааль" в геномике — возможность лучше предсказывать, как гены животного влияют на его физические или поведенческие черты, — получили справочное руководство, которое должно ускорить открытия генов в областях от борьбы с вредителями до персонализированной медицины.
В статье, опубликованной в Nature, генетики из Университета штата Северная Каролина совместно с учёными со всего мира описывают новое справочное руководство — Drosophila melanogaster Reference Panel, или DGRP. Доктор Труди Маккей, ведущий автор статьи, поясняет, что панель содержит 192 линии плодовых мушек, которые сильно различаются по генетической вариативности, но идентичны внутри каждой линии, а также данные их генетической последовательности.
Эти ресурсы общедоступны для исследователей, изучающих так называемые количественные признаки — характеристики, которые варьируются и зависят от множества генов (например, агрессия или чувствительность к алкоголю). Маккей ожидает, что панель принесёт пользу в исследованиях от эволюции животных до моделей болезней на мухах.
На количественные признаки также влияют условия окружающей среды. Однако изучение вариаций этих характеристик (фенотипов) у инбредных мушек в контролируемых условиях, по словам Маккей, может значительно помочь в раскрытии секретов количественных признаков.
"Каждая линия мушек в панели по сути генетически идентична, но при этом каждая линия — это разный образец генетической вариативности в популяции", — говорит Маккей. Это позволяет делиться линиями в научном сообществе для измерения интересующих признаков.
В статье Nature показано, что в целом многие гены были связаны с тремя изученными количественными признаками у мушек:
- устойчивость к стрессу от голодания,
- время восстановления после холодовой комы,
- реакция испуга.
Причём эффекты этих генов были довольно велики.
"До сих пор у нас была информация, чтобы понять, чем плодовая мушка отличается, скажем, от комара", — говорит Маккей. "Теперь мы понимаем генетические различия, ответственные за индивидуальную вариативность, то есть почему один штамм мушек живёт дольше или более агрессивен, чем другой".