Учёные представили наиболее полную последовательность генома картофеля

Исследователи из Вагенингенского университета (WUR) и компании Solynta, создавшей технологию гибридной селекции картофеля, опубликовали на сегодняшний день наиболее полную последовательность генома картофеля. Уникальность работы в том, что как последовательность, так и растительный материал стали доступны для исследований (на определённых условиях). В будущем это может привести к созданию картофеля, более устойчивого к жаре, засухе или болезням.

Картофель — одна из важнейших продовольственных культур в мире, поэтому улучшение его свойств может иметь большое значение. Однако прочитать структуру его генома крайне сложно, поскольку обычный картофель содержит четыре генома, что затрудняет определение положения генов. В данном исследовании использовали диплоидное растение настоящего картофеля с одним геномом — так называемый гомозигот (Solyntus). Это упрощает чтение и сравнение последовательности ДНК. Это растение было получено в рамках программы гибридной селекции картофеля Solynta.

Последовательность генома доступна по адресу: http://www.plantbreeding.wur.nl/Solyntus

От 125 000 до 185 сегментов

Профессор кафедры селекции растений WUR Ричард Виссер высоко оценивает новую последовательность: «Ранее доступная последовательность генома, в создании которой я также участвовал, состояла примерно из 125 000 небольших сегментов. Представленный нами геном состоит из 185 крупных сегментов. Это значительное улучшение, достигнутое благодаря комбинации уникального растительного материала и новых методов секвенирования и анализа. Если предыдущая последовательность была получена для дикого сорта картофеля, то теперь мы использовали настоящее растение картофеля. Я надеюсь и ожидаю, что наша работа в конечном итоге приведёт к более эффективному и быстрому процессу селекции картофеля».

Директор по исследованиям и разработкам Solynta Пим Линдхаут также доволен сотрудничеством: «Этот конкретный результат государственно-частного партнёрства доказывает, что вместе мы можем быстрее описывать и скрещивать новые свойства. Два года назад мы показали, что можем создать устойчивое к болезням растение картофеля за два года. Этот последний прорыв означает, что мы также можем быстрее исследовать и использовать другие признаки. Я убеждён, что это гораздо раньше приведёт к более устойчивому производству картофеля».

Более быстрая и целенаправленная селекция

Различные исследовательские проекты в WUR используют как растение, так и последовательность, что позволяет учёным связывать экспериментальные результаты с генетическим кодом. Очень точная последовательность генома позволяет вести более быструю и целенаправленную селекцию, поскольку в ДНК легче найти, какие скрещивания с другими сортами могут представлять интерес и где в идеале должен происходить обмен генетическим материалом между «отцом» и «матерью». Это означает, что учёные на раннем этапе знают, обладает ли картофель желаемыми признаками, например, устойчивостью к определённым заболеваниям.