Создана база данных пищевого микробиома

Исследователи создали крупнейшую базу данных микробиома пищи, секвенировав метагеномы 2533 различных продуктов. Они идентифицировали 10 899 пищевых микроорганизмов, половина из которых оказалась ранее неизвестными видами.

Ключевые результаты

• Объем данных: Проанализировано 2533 метагенома из 50 стран, включая 1950 впервые секвенированных.
• Состав микробиома: Выявлено 1036 видов бактерий и 108 видов грибов.
• Влияние на человека: Пищевые микробы составляют в среднем около 3% микробиома кишечника взрослого человека и более 50% — микробиома новорожденных.
• Сходства и различия: Схожие продукты (например, ферментированные напитки) содержат схожие микробные сообщества. При этом продукты с отдельных ферм или предприятий имеют уникальные микробные "отпечатки".

Методология и значение

Исследование впервые применило метагеномику в таком масштабе для анализа пищи, что позволило преодолеть ограничения традиционного культивирования микробов.

Практическое применение базы данных включает:

• Контроль качества, безопасности и подлинности продуктов.
• Поддержку производителей в создании стабильных и желательных продуктов.
• Изучение влияния пищевых микробов на здоровье человека.

Исследование опубликовано 29 августа в журнале Cell, база данных находится в открытом доступе. Работа выполнена в рамках консорциума MASTER EU.