Атлас организма
Хотя каждая клетка организма содержит одинаковые гены, в любой ткани на определенной стадии развития экспрессируется лишь их часть. Знание масштабов транскрипции генов важно, и команда европейских исследователей создала атлас экспрессии генов для развивающегося эмбриона мыши. Это станет мощным ресурсом для определения коэкспрессии генов и выявления функциональных связей между генами, важными для развития и заболеваний. Результаты будут опубликованы на следующей неделе в открытом онлайн-журнале PLoS Biology.
Комплексный, интерактивный и свободно доступный цифровой атлас экспрессии генов (www.eurexpress.org) включает данные по экспрессии более 15 000 генов в сотнях анатомических структур и позволил идентифицировать тканеспецифичные и перекрывающиеся тканевые генетические сети. Например, данные раскрыли новую информацию о нескольких развивающихся структурах, таких как теленцефалон, показали новую организацию гипоталамуса и дали представление о сигнальных путях, вовлеченных в дифференцировку почечного эпителия во время развития почки.
В проекте участвовали исследователи из 12 различных европейских институтов из 6 стран (Италия, Испания, Великобритания, Германия, Франция и Швейцария).
«Эта работа стала возможной только благодаря тесному сотрудничеству всех вовлеченных ученых и наглядно иллюстрирует успех, которого можно достичь скоординированными и совместными усилиями. Атлас экспрессии генов станет важным руководством для открытия функции генов и механизмов заболеваний», — говорит профессор Андреа Баллабио, координатор исследования из Института генетики и медицины Телетон в Неаполе, Италия.
«Масштаб задачи потребовал команды специалистов, чье сочетание различных экспертиз было необходимо для достижения результата, превосходящего сумму отдельных частей; свободно доступные данные и впечатляющие изображения будут большим подспорьем для всех исследователей, работающих над функцией генома и молекулярными причинами мириад генетических расстройств», — говорит профессор Стилианос Антонаракис, один из участников этого исследования в Университете Женевы.