Крупный шаг к созданию всеобъемлющего атласа клеток человека

Международная команда исследователей из Китая сделала значительный шаг к созданию всеобъемлющего атласа клеток человека. В статье, опубликованной в журнале Nature, группа описала, как они секвенировали РНК более полумиллиона отдельных клеток, полученных от добровольцев, и обработали информацию для представления в виде, пригодном для атласа.

Все клетки человеческого тела несут одну и ту же генетическую информацию — они различаются тем, какие гены в них экспрессируются. Именно эти экспрессируемые гены определяют функцию конкретной клетки. Медицинские исследователи давно стремятся создать атлас, который описывал бы, какие гены экспрессируются в клетках всех частей тела. Такой атлас помог бы лучше понять функции клеток и их взаимодействие, а также сэкономил бы время на новых исследованиях. Атласы уже созданы для некоторых типов тканей, но единого атласа, охватывающего все типы клеток человеческого тела, пока нет. Создание такого атласа потребует многих лет усилий, учитывая, что в человеческом теле более 30 триллионов клеток. В этой новой работе исследователи сделали крупный шаг к цели, предоставив информацию об экспрессии генов для более чем 500 000 клеток из разных частей тела (включая некоторые клетки фетальных тканей), охватывающих все основные органы.

Работа включала сначала получение образцов тканей, а затем их обработку. Клетки изолировали с помощью центрифуги или ферментов. После изоляции каждую клетку секвенировали с помощью специального инструмента, ранее разработанного командой, — Microwell-seq, который позволяет быстро секвенировать большое количество клеток. В общей сложности команда секвенировала клетки 60 типов тканей. Затем исследователи сгенерировали карту, используя разработанный ими метод классификации клеточной информации. Эта карта и лежащие в её основе данные формируют основу для потенциально полной и всеобъемлющей базы данных отдельных клеток.