Идентифицированы наиболее опасные штаммы смертоносной бактерии E. coli

Исследователи из Медицинской школы Университета Мэриленда (UM SOM) впервые определили генетический состав различных штаммов E. coli, ежегодно уносящей сотни тысяч жизней по всему миру.

В статье, опубликованной в Nature Microbiology, проанализирована ДНК энтеропатогенной Escherichia coli (EPEC) — штаммов бактерии, вызывающих диарею.

Учёные под руководством Дэвида Раско и Майкла Донненберга выявили определённые штаммы, которые обычно значительно более летальны, чем другие. Результаты помогут сфокусировать усилия на выявлении, лечении и потенциальном контроле этих более опасных версий. Это может привести к лучшему пониманию того, как именно бактерия наносит ущерб, и, в конечном итоге, к более эффективным методам лечения, которые могут значительно снизить смертность от диарейных заболеваний — ведущей причины детской смертности в мире. Ежегодно диарея убивает около 760 000 детей в возрасте до пяти лет и является основной причиной недоедания в этой возрастной группе. Во всём мире регистрируется почти 1,7 миллиарда случаев диарейных заболеваний в год.

Исследователи, включая коллег из Гамбии, Мали, Кении, Мозамбика, Индии, Пакистана и Бангладеш, изучили геномы 70 штаммов E. coli, полученных от инфицированных детей, участвовавших в глобальном многоцентровом исследовании GEMS. Некоторые случаи были связаны со смертью, другие — с симптомами, но без летального исхода, третьи — без симптомов; таким образом, у учёных был доступ к штаммам с различными исходами.

Они проанализировали генетические различия между штаммами и сопоставили их с клиническим исходом. Затем разделили штаммы на категории на основе генетического содержания и клинического результата. Пока неясно, как генетические вариации могут быть связаны с симптомами и исходами, но выявленная закономерность открывает широкое поле для дальнейших исследований. Предполагается, что повышенная летальность E. coli вызвана взаимодействием группы генов, а не одного или двух.

Эта работа является примером «геномной эпидемиологии» — нового подхода в науке общественного здравоохранения, который интегрирует передовые технологии с глубокими знаниями о патогенных бактериях.