Разработан онлайн-атлас иммунома человека для прецизионной медицины

Ученые из SingHealth Duke-NUS Academic Medical Centre (AMC) создали интерактивный веб-атлас иммунома человека — генов и белков, составляющих иммунную систему. Атлас, названный EPIC (Extended Polydimensional Immunome Characterisation), содержит всеобъемлющую и расширяющуюся базу данных об иммунных клетках — от пуповинной крови до взрослого возраста. Им может пользоваться мировое научное сообщество для изучения механизмов иммунитета. Работа команды недавно опубликована в журнале Nature Biotechnology.

Изучение иммунома человека — ключ к пониманию, почему люди по-разному реагируют на вирусы, терапию и вакцины. EPIC призван углубить эти исследования, предоставляя карту иммунной системы и используя искусственный интеллект (ИИ) для стратификации и анализа данных.

Профессор Сальваторе Альбани, руководитель исследования, пояснил: «Изучение иммунома человека подобно МРТ-сканированию тела на клеточном уровне... Мы надеемся, что EPIC поможет клиницистам и ученым понять механизмы иммунитета, прогнозировать клинические ответы для прецизионной медицины и даже сыграть роль в поиске новых вакцин и методов лечения».

Возможности EPIC:

• Для исследований: Ученые могут изучать архитектуру иммунома для разных возрастных групп или анализировать конкретные типы клеток.
• Для терапии: Данные EPIC помогают принимать обоснованные решения о выборе терапии и находить новые мишени для лечения, соответствующего разным иммунным системам.
• Для разработки вакцин: EPIC может ускорить поиск иммунных сигнатур, предсказывающих реакцию организма на потенциальные вакцины. Команда профессора Альбани уже использует EPIC в глобальном поиске вакцины против COVID-19.

В настоящее время EPIC используется клиницистами и исследователями для изучения таких заболеваний, как артрит, рак печени и иммунодефициты.

Доктор Йео Джу Гуан отметил практическую пользу атласа: «EPIC предоставляет большой набор данных по цитометрии здоровых людей и правильные инструменты для их анализа... Его уникальность — в динамичном и интерактивном формате представления данных».

EPIC изначально содержал данные только об азиатских фенотипах, но со временем расширился, включив наборы данных об иммунных клетках из региональных и международных источников, включая Европейский союз и США. Это инструмент с открытым исходным кодом, доступный всем исследователям, что позволяет любому вносить образцы, данные и новые инструменты анализа.