Исследователи создали новый сенсор для метилированной ДНК

Ученые из альянса Mayo-Illinois Alliance for Technology Based Healthcare разработали новый одно-молекулярный тест для обнаружения метилированной ДНК. Метилирование — добавление метильной группы к цепи ДНК — это один из способов регуляции экспрессии генов. Результаты опубликованы в текущем выпуске журнала Scientific Reports.

«Хотя нанопоры изучались для геномного секвенирования и скринингового анализа, этот новый анализ потенциально может обойти необходимость некоторых текущих процессов в оценке заболеваний, связанных с эпигенетикой», — говорит Джордж Вашмацис, доктор философии, со-руководитель программы Mayo's Biomarker Discovery Program в Центре индивидуализированной медицины и со-ведущий автор статьи. Он отмечает, что анализ может устранить необходимость в бисульфитной конверсии ДНК, флуоресцентном мечении и полимеразной цепной реакции (ПЦР).

«Следующие шаги включают увеличение пространственного разрешения за счет использования более тонких мембран и интеграции тех же этапов подготовки», — говорит Рашид Башир, доктор философии, профессор биоинженерии, директор лаборатории микро- и нанотехнологий и со-ведущий автор исследования в Университете Иллинойса в Урбане-Шампейне.

Нанопора в данном случае — это очень маленькое отверстие в искусственной мембране, позволяющее локализовать и идентифицировать лишь одну молекулу. Исследователи утверждают, что это полезно, поскольку метилирование в промоторных последовательностях может указывать на развитие опухоли в большинстве основных типов рака и может быть лучшим биомаркером, чем многие генетические маркеры. Ученые теперь могут отличать метилированную ДНК от неметилированной, присоединяя белок к метилированным нуклеотидам и измеряя ионный электрический ток через твердотельную нанопору.