Обнаружены новые вирусы в популяциях исчезающих диких тихоокеанских лососей

В популяциях исчезающих чавычи и нерки обнаружены три новых вируса, включая один из группы вирусов, ранее никогда не показанных как инфицирующие рыб.

Хотя влияние этих вирусов на здоровье лосося пока неизвестно, все три родственны вирусам, вызывающим серьёзные заболевания у других видов.

«Мы были удивлены, обнаружив вирусы, которые ранее никогда не показывали способности инфицировать рыб», — сказал Гидеон Мордехай, исследователь из департамента наук о земле, океане и атмосфере Университета Британской Колумбии (UBC). «Хотя риска для людей нет, один из вирусов эволюционно связан с респираторными коронавирусами и локализован в жабрах. Это предполагает, что у него схожая стратегия заражения с его дальними родственниками, инфицирующими млекопитающих».

Исследователи из UBC и Министерства рыболовства и океанов Канады использовали секвенирование ДНК с последующими специфичными тестами на каждый вирус для скрининга более 6000 лососей вдоль побережья Британской Колумбии, включая диких, выращенных в инкубаторах и на аквафермах рыб.

«Мы обнаружили новые вирусы широко распространёнными у мёртвых и умирающих лососей с ферм и у диких лососей», — сказал вирусолог UBC Кёртис Саттл. «Это подчёркивает потенциальную роль, которую вирусные заболевания могут играть в популяционной динамике диких рыбных запасов, и угрозу, которую эти вирусы могут представлять для аквакультуры».

Один новый вирус, чаще выявляемый в инкубаторах, инфицировал более 15% всех протестированных мальков чавычи из инкубаторов.

Другой новый вирус был обнаружен у 20% чавычи с рыбных ферм, но только у взрослых или полувзрослых особей. В целом новые вирусы чаще обнаруживались у культивируемых популяций рыб, чем у диких.

«Крайне важно определить, являются ли эти вирусы важными факторами в сокращении популяций чавычи и нерки», — сказал Саттл. «Исследование подчёркивает необходимость тщательного эпиднадзора для улучшения нашего понимания того, как вирусы могут влиять на здоровье популяций дикого тихоокеанского лосося».

За последние 30 лет устойчивое сокращение популяций чавычи и нерки вызывает большую озабоченность у коренных народов, коммерческих и рекреационных рыболовов и общественности. Хотя основное внимание уделялось влиянию писквинового ортореовируса (PRV), новые данные подчёркивают, как мало известно о других вирусах, эндемичных для популяций лосося.

«Возможность проскринировать так много рыб на эти вирусы стала захватывающим прорывом и позволила нам выявить очаги инфекции», — добавляет Мордехай.

«Один из вирусов был относительно распространён у молоди мигрирующего лосося при входе в океан — в период, считающийся критическим для их выживания до взрослого состояния».

Работа финансировалась в рамках Стратегической инициативы по здоровью лосося — партнёрства Genome BC, Министерства рыболовства и океанов Канады и Фонда тихоокеанского лосося.

Результаты опубликованы в журнале eLife.