Исследователи представили карту для изучения новой формы межклеточной коммуникации
Международная команда под руководством исследователей из Медицинского колледжа Бейлора в рамках Консорциума по изучению внеклеточной РНК Национальных институтов здравоохранения (NIH) и лаборатории Богдана Матееску в ETH Zürich и Университете Цюриха создала новый мощный ресурс для изучения внеклеточной РНК (exRNA) — новой формы межклеточной коммуникации.
Исследование, опубликованное в журнале Cell Genomics, закладывает основу для изучения того, как exRNA и её белки-переносчики, обнаруженные в биологических жидкостях, функционируют как в здоровом, так и в болезненном состоянии. Это потенциально может обеспечить точные методы раннего выявления и мониторинга заболеваний.
Рибонуклеиновая кислота (РНК) — это один из типов генетического материала, присутствующий внутри всех живых клеток. Она известна в основном как молекула-посредник, несущая инструкции, закодированные в ДНК, для синтеза белков.
В последние годы исследования показали, что РНК существует не только внутри клеток, но и экспортируется из них в виде внеклеточной РНК и играет роль в межклеточной коммуникации.
"ExRNAs присутствуют в биологических жидкостях вне клеток, где они могут связываться с различными переносчиками, включая РНК-связывающие белки (RBP), но груз и распределение RBP по биожидкостям в значительной степени неизвестны. Нашей целью в этом исследовании было заполнить этот пробел. Это серьёзное упущение ограничивало наше понимание роли RBP как переносчиков exRNA в биологических жидкостях человека. Наши результаты открывают новый путь к пониманию биологии exRNA и предоставляют новые возможности для разработки биомаркеров exRBP/exRNA для жидкой биопсии".
Исследователи применили вычислительный анализ для идентификации exRBP в плазме, сыворотке, слюне, моче и спинномозговой жидкости. Вычислительные прогнозы были экспериментально подтверждены примерно на 80% как в плазме, так и в клеточных культурах в лаборатории, что указывает на высокую специфичность вычислительного метода.
"Используя эту информацию, мы разработали карту кандидатных exRBP и их exRNA-груза в биологических жидкостях, расширив ландшафт потенциальных биомаркеров, которые теперь можно изучать с помощью жидкой биопсии и использовать для отслеживания нормальных и патологических процессов. Мы представляем эту карту как ресурс, доступный научному сообществу бесплатно".