Новый метод позволяет анализировать отдельные нейроны из тканей
Ученые из Каролинского института в Швеции разработали новый метод LCM-seq, который позволяет выделять отдельные нейроны из тканей и анализировать экспрессию генов в них. Исследование опубликовано в Nature Communications.
Суть метода:
Метод сочетает две существующие технологии:
- Лазерную микродиссекцию (LCM) для выделения конкретных клеток из образцов ткани.
- Глубокое секвенирование РНК для изучения всех активных генов в этих клетках.
Ключевые преимущества:
- Высокая чувствительность: позволяет анализировать очень малое количество клеток, вплоть до единичных нейронов, из тканей человека и мыши.
- Сохранение информации: ткань не разрушается, что сохраняет позиционную информацию в каждой изолированной клетке.
- Простота и воспроизводимость: метод проще, дешевле и имеет более высокую воспроизводимость по сравнению с предыдущими подходами, так как не требует очистки молекул РНК и использует стандартные реагенты.
Применение в неврологии:
Метод продемонстрировал свою эффективность для различения тесно связанных популяций нейронов с разной уязвимостью к болезням:
- БАС (боковой амиотрофический склероз): изучение моторных нейронов из разных отделов спинного мозга.
- Болезнь Паркинсона: идентификация специфических различий между дофаминовыми клетками среднего мозга, подверженными атрофии, и устойчивыми к заболеванию.
Перспективы:
Благодаря возможности работать с малым количеством клеток, метод LCM-seq может иметь значительную ценность и в других областях, таких как онкология, патология и идентификация биомаркеров.