Наночастицы позволили обнаружить низкоабундантные белки в плазме крови

В недавнем исследовании, опубликованном в Nature Communications, учёные из отдела микробиологии, опухолей и клеточной биологии Каролинского института совместно с Университетом штата Мичиган представили инновационный подход для улучшения профилирования протеома плазмы. Они разработали новый метод, позволяющий детектировать низкоабундантные белки в плазме.

Плазма — богатый источник биомаркеров, важных для мониторинга здоровья и болезней. Однако открытие новых биомаркеров замедлилось из-за сложности обнаружения низкоабундантных белков.

Высокоабундантные белки, такие как альбумин, доминируют в масс-спектрах, что затрудняет идентификацию потенциальных биомаркеров, присутствующих в малых количествах. Существующие методы удаления этих высокоабундантных белков часто дороги и трудоёмки, что ограничивает их использование в крупномасштабных исследованиях.

Новый метод использует природную малую молекулу — фосфатидилхолин — для удаления высокоабундантных белков (альбумина, серотрансферрина, гаптоглобина) из образцов плазмы. Комбинируя фосфатидилхолин с одной наночастицей, исследователи смогли количественно определить около 1450 белков в одном образце плазмы.

"Наша запатентованная технология, сочетающая фосфатидилхолин с одной наночастицей, значительно увеличивает глубину профилирования протеома плазмы. Это позволяет нам изучать белки с более низкой распространённостью, прокладывая путь к открытию новых биомаркеров", — говорит Амир Ата Саей, один из ведущих авторов и доцент отдела микробиологии, опухолей и клеточной биологии Каролинского института.

Раннее обнаружение таких заболеваний, как рак и нейродегенеративные расстройства, критически важно для эффективной профилактики и лечения. Новый метод может привести к значительному прогрессу в идентификации биомаркеров для этих состояний.

"Эта особенность позволит нам изучать белки с более низкой распространённостью для открытия новых биомаркеров против целого ряда заболеваний, особенно различных типов рака и нейродегенеративных болезней", — отмечает Ата Саей.