Молекулярные маркеры исследуют структуру природных популяций и локусы, связанные с признаками, у кивиберри

Актинидия аргута (Actinidia arguta), также называемая кивиберри или мини-киви, отличается от других киви небольшим размером, гладкой съедобной кожицей без опушения и сладким ароматом. Это один из наиболее широко выращиваемых в коммерческих садах видов актинидии.

Исследователи из Уханьского ботанического сада Китайской академии наук совместно с коллегами оценили генетическое разнообразие и структуру популяции 189 образцов, генотипированных с помощью 200 маркеров SSR (простых последовательных повторов).

Всего у образцов из семи диких популяций было идентифицировано 2496 аллелей. Анализ популяционной структуры показал, что образцы можно разделить на четыре подгруппы, каждая из которых соответствовала географическому расстоянию.

Ассоциативный анализ выявил 35 маркеров SSR, значимо связанных с признаками плода, такими как пол растения и цвет мякоти. Маркер LR71, обнаруженный в этом исследовании, был значимо ассоциирован с цветом и сцеплен с транскриптом, кодирующим белок MYB-транскрипционного фактора.

Это первое исследование, в котором для генетического ассоциативного картирования у A. arguta использовано такое большое количество диких генетических образцов с применением геномики и анализа транскрипции генов с помощью SSR. Результаты станут важным ресурсом для понимания молекулярных взаимосвязей A. arguta с другими видами Actinidia и для маркер-опосредованной селекции.

Результаты опубликованы в журнале Scientia Horticulturae.