Идентифицированы гены AP2/ERF, потенциально регулирующие развитие цветка у киви

AP2/ERF — одно из крупнейших семейств транскрипционных факторов у растений, играющее важную роль в различных процессах. В ходе длительной эволюции функции и количество генов AP2/ERF значительно изменились. Цветение — популярная тема исследований, и оно также связано с генами AP2/ERF. Однако их роль в цветении Actinidia eriantha (киви) оставалась малоизученной.

Исследователи из Уханьского ботанического сада Китайской академии наук идентифицировали и охарактеризовали семейство AP2/ERF в геноме A. eriantha и объяснили эволюцию этого семейства у двух основных видов киви. Также были предсказаны несколько ключевых регуляторов развития цветка.

Основные результаты:

• В геноме A. eriantha идентифицировано 158 генов AP2/ERF, разделённых на четыре основных подсемейства.
• Эти гены демонстрируют хорошую коллинеарность внутри вида. Многие из них прошли события дупликации и находятся под действием очищающего отбора.
• Анализ структуры генов и белковых мотивов показал, что AP2/ERF в разных семействах более консервативны.
• Треть генов AeAP2/ERF оказалась сильно связана с переходом к цветению, согласно RNA-seq данным разных стадий цветения.
• Среди них два гена экспрессировались особенно обильно, что указывает на их потенциально важную роль в регуляции развития цветка и формировании цветочных тканей.

Это исследование представляет собой первый комплексный анализ генов AP2/ERF у киви и создаёт основу для скрининга генов с целью их дальнейшей функциональной идентификации и генетического улучшения агрономических признаков культуры.

Работа опубликована в журнале BMC Genomics под названием "Genome-wide identification and characterization of AP2/ERF gene superfamily during flower development in Actinidia eriantha".