Исследование многоножек 2.0: Новое измерение в описании видов
Первое научное описание нового вида обычно основано на одном экземпляре, обозначенном как голотип, и нескольких дополнительных — паратипах. Эти редкие или уникальные образцы хранятся в музеях, что затрудняет их непосредственное изучение другими учёными.
Традиционно таксономические описания полагались на рисунки и фотографии. Современная 3D-визуализация, в частности рентгеновская микротомография (microCT), добавляет не только третье измерение, но и возможность широкого распространения данных.
Цифровая копия физического голотипа или паратипа называется кибертип. Подобно аватару, он позволяет музейному образцу войти в мир веб-исследований биоразнообразия.
Доктор Несрин Аккари и коллеги опубликовали описание нового вида многоножки из Испании, усиленное кибертипом. Вид назван Ommatoiulus avatar в честь его цифрового альтер эго. Это первый новый вид, описанный с помощью детальных 3D-изображений реальных типовых экземпляров, чьи кибертипы опубликованы как открытый ресурс.
«Использование виртуальных образцов показывает, сколько полезных научных данных можно получить без препарирования оригинала, что часто неизбежно при изучении гениталий многоножек. В то же время это позволяет получить общий обзор различных анатомических структур и их естественного положения беспрецедентным способом», — сказала доктор Аккари.
Многоножки оказываются гораздо более разнообразными в мировом масштабе, чем считалось ранее. Опубликованные 3D-изображения имеют микроскопическую детализацию с разрешением в несколько микрометров, поэтому их может изучать любой исследователь в мире вместо реальных образцов.
Изображения, видео и 3D-данные кибертипов доступны бесплатно в репозитории Dryad. Физические голотип и паратипы хранятся в Музеях естественной истории Вены и Дании.
«Эти кибертипы — высокоточные 3D-представления анатомии физического образца, и их может изучать и использовать кто угодно», — отметил Брайан Метчер, руководитель лаборатории microCT-визуализации Венского университета.
Доктор Аккари подчеркивает, что это описание — пример того, как таксономическая наука перестаёт быть «старомодной» и отражает современные способы производства и обмена знаниями.
«Аватары не заменят реальные типы, но, несомненно, добавят большую ценность коллекциям музеев, особенно хрупким и уникальным образцам».
Профессор Хенрик Энгхофф указывает на масштаб задачи: описано почти два миллиона видов, но в несколько раз больше остаются неизвестными науке. Применение microCT к таксономическому процессу позволяет делать эту работу гораздо лучше.
«Кибертип нашей многоножки Ommatoiulus avatar — пока единственный предшественник, но за ним обязательно последуют другие».