Как микробы выносят мусор: новый взгляд на механизм защиты от токсинов

Исследователи из Университета Аризоны детально изучили молекулярную машинерию, которую бактерии используют для избавления от токсичных веществ, включая противомикробные препараты. Понимание этих механизмов может привести к созданию нового оружия в борьбе с патогенами.

Медь: обоюдоострый меч для микробов

Микроорганизмы выживают в экстремальных условиях благодаря сложным клеточным механизмам, регулирующим уровень необходимых, но опасных в избытке веществ.

"Медь — это обоюдоострый меч для организмов, потому что она жизненно важна для некоторых ферментов, но в больших количествах токсична и может убить клетку", — объясняет Кристофер Ренсинг.

Баланс поддерживается специализированными транспортными белками (насосами), встроенными в клеточные мембраны. Они действуют как "мусорщики", выводя токсичные ионы металлов из клетки.

Пересмотр модели работы RND-транспортеров

Изучая класс транспортных белков RND, команда под руководством Ын-Хэ Ким, Меган МакЭвой и Кристофера Ренсинга предложила новую рабочую модель их функционирования. Результаты опубликованы в Journal of Bacteriology.

Ключевой вопрос для микроба: как избавиться от избытка меди, сохранив достаточно для жизненных процессов?

Белковый насос состоит из нескольких компонентов:

  1. Два белка, встроенных в две мембранные оболочки бактериальной клетки.
  2. Белок слияния мембран (membrane fusion protein), который действует как мост между ними.

Вся сборка образует туннель, соединяющий внутреннюю часть клетки с внешней средой.

"Модель переключателя": новая гипотеза

Исследование Ын-Хэ Ким противоречит прежней гипотезе о пошаговой передаче ионов меди. Вместо этого команда предлагает "модель переключателя":

  1. Белок слияния мембран действует как датчик и переключатель. У него есть шесть сайтов связывания для меди.
  2. Механизм запускается только при насыщении всех шести сайтов достаточным количеством меди.
  3. Активация вызывает изменение формы белка, которое "включает" другие компоненты транспортного комплекса и запускает процесс откачки ионов.

"Предыдущие исследования предполагают, что он может открываться, как диафрагма объектива, прежде чем начать выкачивать ионы меди из клетки", — поясняет Ким.

Значение для медицины и не только

Эта модель — инструмент для изучения не только медных насосов. Аналогичные молекулы позволяют:

  • Бактериям — выводить антибиотики.
  • Раковым клеткам — выбрасывать химиотерапевтические препараты.

"Если вы знаете компоненты, вы можете разработать лекарства, которые нацелены именно на них, убивая только те бактерии, у которых они есть. Это минимизирует побочные эффекты", — говорит Ренсинг.

Пример применения: макрофаги (клетки иммунной системы) используют медные насосы, чтобы создать токсичную для микробов среду в очаге воспаления. Если заблокировать транспортеры бактерий, это создаст их "ахиллесову пяту", сделав уязвимыми для атаки макрофагов.

Глобальное значение и будущее

RND-транспортеры найдены даже у бактерий в экстремальных средах, например, в глубинных водах желоба Пуэрто-Рико. Их точная роль там пока неизвестна.

"Металлы и их доступность для микробов оказывают огромное влияние на глобальные циклы, включая климат. Изучение роли металлов в этих процессах — это новый научный рубеж", — заключает Ренсинг.

Возвращение к металлам как основе для противомикробных препаратов (например, "серебряных пуль") становится особенно актуальным в эпоху растущей антибиотикорезистентности.

2011-05-10