Идентификация транспортного белка в микобактериях новым методом

Исследователи из Фрайбургского университета под руководством д-ра Клаудии Йессен-Трефцер идентифицировали транспортный белок в микобактериях, ответственный за поглощение питательного вещества L-арабинофуранозы. Ведущие авторы работы — Миаомяо Ли, Кристоф Мюллер и Клеменс Фрёлих — использовали новый подход, который может упростить поиск подобных белков в будущем. Эти белки могут стать ключевой мишенью для разработки новых лекарств против заболеваний, вызываемых микобактериями, например, туберкулеза. Исследование опубликовано в журнале Cell Chemical Biology.

Транспортные белки расположены в клеточной мембране и отвечают за поглощение питательных веществ и выведение токсинов, то есть за жизненно важные процессы. До сих пор они были мало изучены из-за сложных химических свойств. В качестве модельного организма использовалась подгруппа бактерии Mycobacterium smegmatis.

Команда разработала метод, в котором экспрессию генов (целенаправленное включение генов и трансляцию в белки) запускали через субстрат (питательное вещество). Затем белки, выделенные из мембраны, исследовали с помощью масс-спектрометрии. Это дало исследователям относительно простой способ идентификации транспортных белков, ответственных за поглощение определенного питательного вещества.

В результате был идентифицирован транспортер L-арабинофуранозы, чьи характеристики удалось определить с помощью белковой кристаллографии. Метод значительно упрощает идентификацию транспортных белков в микобактериях и вносит вклад в поиск потенциальных белков-мишеней для разработки антибиотиков.