Исследование микробной экологии в помещениях начинается с отбора проб в общественных туалетах
Изучение микробной экологии в зданиях, где мы живем (так называемая "построенная среда"), — это новая область. В отличие от традиционной экологии, она фокусируется на микроорганизмах внутри помещений, что важно, учитывая, сколько времени мы проводим в зданиях.
Цель исследования: Проверить гипотезу о том, что постоянное воздействие антимикробных химикатов (из чистящих средств, красок, напольных покрытий) на бактерии внутри помещений может способствовать распространению антибиотикорезистентности.
Методы и полевая работа:
- Отбор проб пыли в общественных зданиях (начинается с кампуса Университета Орегона) и, в дальнейшем, в жилых домах.
- Пыль собирается в труднодоступных местах (углы, пространства за трубами, верхние части стен) с помощью портативного пылесоса со специальными фильтрами.
- Пробы анализируются двумя основными способами:
- Генетический анализ: Экстракция ДНК и секвенирование следующего поколения для определения состава микробного сообщества и поиска генов устойчивости.
- Химический анализ: Использование высокоточной масс-спектрометрии для выявления и измерения уровня антимикробных химикатов в пыли.
- Задача — сопоставить данные о химическом составе пыли с данными о наличии у бактерий генов устойчивости.
Масштаб проекта:
- В исследовании напрямую задействовано около 15 человек из четырех различных дисциплин.
- Полный цикл — от замысла до публикации в рецензируемом журнале — займет более года.
- Стоимость составляет десятки тысяч долларов (без учета зарплат и косвенных расходов).
Научная и практическая значимость:
Работа носит серьезный характер, так как направлена на поиск резервуаров устойчивых к антибиотикам патогенов. Обнаружение конкретных источников или практик, усиливающих резистентность, может помочь сдержать ее распространение и сохранить арсенал эффективных антибиотиков.