Новый метод MAbID позволяет одновременно изучать несколько механизмов регуляции генов
ДНК плотно упакована в ядре клетки, оборачиваясь вокруг белков-гистонов. Эти комплексы ДНК и гистонов называются хроматином. Способ упаковки хроматина определяет, какие участки генетического материала могут быть «прочитаны» клеткой и, следовательно, какие гены будут активны. Этот паттерн экспрессии генов различается для разных типов клеток и может меняться со временем.
На активность генов влияют два ключевых механизма:
- Модификации гистонов — химические изменения в самих гистонах.
- Связывание белков с хроматином.
Оба процесса влияют на «читаемость» ДНК. Ранее для их изучения требовались отдельные эксперименты.
Группа Йопа Кинда разработала новую технологию MAbID (Multiplexing Antibody-based detection). Она позволяет одновременно исследовать в одной клетке несколько типов модификаций гистонов и белков, связанных с хроматином.
Преимущества метода:
- Эффективность: Исключает необходимость в отдельных экспериментах для каждого механизма.
- Интегративный взгляд: Позволяет увидеть, как различные механизмы регуляции генов взаимодействуют — работают вместе или друг против друга.
Области применения MAbID:
- Фундаментальные исследования: Понимание работы регуляции генов во время развития человека или животных.
- Медицинские исследования: Изучение заболеваний, вызванных нарушениями в регуляции генов, таких как рак.
Технология MAbID может в будущем дать важные insights как для понимания здоровья, так и для изучения болезней.
Исследование «Combinatorial single-cell profiling of major chromatin types with MAbID» опубликовано в журнале Nature Methods.