Новый инструмент исследует регуляцию генов

ДНК-метилирование (DNAme) — это модификация генома, эпигенетическая "метка", необходимая для правильной клеточной дифференцировки. Оно вовлечено в регуляцию экспрессии генов, но его роль в этом поэтапном процессе изучена плохо.

Эмили Ходжес, доктор философии, аспирантка Келли Барнетт и их коллеги разработали новый инструмент, ATAC-Me, для одновременного измерения DNAme и доступности хроматина в одной и той же популяции молекул ДНК. Исследователи использовали ATAC-Me для изучения дифференцировки белых кровяных клеток от моноцитов к макрофагам.

Они выявили волны доступности хроматина, быстро происходящие на тысячах энхансеров (участков ДНК, вовлеченных в регуляцию экспрессии генов). Также они обнаружили неожиданные пролонгированные состояния метилирования в большинстве этих сайтов, что ставит под сомнение давнее убеждение, что ДНК-метилирование является барьером для активации генов.

Исследование, опубликованное в Molecular Cell, подчеркивает ценность ATAC-Me для изучения роли ДНК-метилирования в регуляции генов.