Геномный анализ указывает на множественные виды косаток

В статье, опубликованной сегодня в журнале Genome Research, учёные сообщают о получении убедительных генетических доказательств в поддержку теории о существовании нескольких видов косаток (Orcinus orca) в океанах мира.

Учёные давно подозревали о существовании более одного вида из-за различий в поведении, пищевых предпочтениях и тонких физических особенностях. Однако до сих пор анализ ДНК был неубедительным из-за невозможности картировать полный генетический профиль, или геном, митохондрий китов — органелл клетки, наследуемых от матери.

«Генетический состав митохондрий у косаток, как и у других китообразных, меняется очень мало со временем, что затрудняет обнаружение дифференциации у недавно образовавшихся видов без изучения всего генома», — сказал Филипп Морен, ведущий автор и генетик из Научного центра рыболовства NOAA на юго-западе в Ла-Хойя, Калифорния. — «Но, используя относительно новый метод, называемый "высокопараллельным секвенированием", для картирования всего генома митохондрий клетки из образцов косаток со всего мира, мы смогли увидеть чёткие различия между видами».

Всего были проанализированы образцы тканей 139 косаток. Образцы были взяты у косаток из северной части Тихого океана, северной части Атлантического океана и океанов, окружающих Антарктиду. В результате исследования предполагается, что два типа косаток в Антарктике, питающиеся рыбой и тюленями соответственно, являются отдельными видами, как и питающиеся млекопитающими «транзитные» косатки северной части Тихого океана. Несколько других типов косаток также могут быть отдельными видами или подвидами, но для этого требуется дополнительный анализ.

Высокопараллельное секвенирование ДНК намного быстрее и дешевле исторических методов анализа. Например, исследование митохондриального генома в одном образце могло занять несколько месяцев. Но с использованием высокопроизводительного секвенирования исследователи могут выполнить тот же анализ для 50 или более образцов всего за несколько недель, а технологии для секвенирования больших частей генома и большего числа особей продолжают быстро совершенствоваться.

Определение количества видов косаток имеет критически важное значение для управляющих ресурсами, чтобы устанавливать приоритеты сохранения и лучше понимать экологическую роль этого крупного и широко распространённого хищника в мировом океане.