Технологический прорыв в изучении клеточной транскрипции
Исследователи под руководством доктора Даниэля Кауфманна из Исследовательского центра университетской больницы Монреаля (CRCHUM) разработали новую технологию, позволяющую детальнее изучать процесс транскрипции генов в клетках.
Суть технологии
Метод, названный «протоколом FISH-исследования» (Fluorescent in situ hybridization), оптимизирует существующие процессы проточной цитометрии. Это значительно повышает видимость транскрипции РНК — ключевого этапа передачи клеточной информации. Результаты опубликованы в онлайн-издании Nature Communications.
Проблема существующих методов
Классическая проточная цитометрия, стандартный инструмент в иммунологии и онкологии, имеет серьёзное ограничение: она эффективна только для изучения белков с помощью специфических антител. Для многих белков таких антител не существует, что делает их недоступными для анализа. Кроме того, такие заболевания, как рак и ВИЧ, часто связаны с проблемой, возникающей до синтеза белка — с нарушением регуляции транскрипции ДНК в матричную РНК. Традиционная цитометрия не могла исследовать этот процесс.
Как работает новый метод
В сотрудничестве с компанией Affymetrix команда доктора Кауфмана преодолела этот барьер. Запатентованная технология включает двухдневный протокол работы с тщательно подобранными химическими реагентами. Используя стандартный проточный цитометр, гибридизационную печь и набор точно дозированных растворов (выступающих в роли микроскопических флуоресцентных зондов), учёные могут получать ранее недоступную информацию непосредственно от клеток.
Значение и перспективы
Как пояснил доктор Кауфман, эта технология открывает более глубокий взгляд на иммунные реакции при различных заболеваниях, включая ВИЧ-инфекцию. Она позволяет напрямую изучать фундаментальный этап передачи генетической информации в клетке.
«В принципе, наша технология применима к любому биологическому виду. Мы можем обнаруживать широкое разнообразие молекул РНК, производимых организмом человека и животных».
Технология обещает серьёзное влияние на исследования, так как в конечном итоге позволит лучше понять механизмы развития болезней и оценить эффективность лекарственных препаратов.