У рыб обнаружены разнообразные и уникальные кишечные микробиомы

Богатое биоразнообразие коралловых рифов распространяется и на микробные сообщества внутри рыб. Исследование, опубликованное в Proceedings of the Royal Society: Biological Sciences, показывает, что несколько важных видов травоядных рыб Карибских коралловых рифов имеют в кишечнике отличные друг от друга микробные сообщества.

«Микробиом, по-видимому, является определяющей характеристикой каждого вида травоядных рыб, такой же уникальной, как её размер или пищевое поведение», — сказал Дуглас Рашер, старший научный сотрудник лаборатории Бигелоу и старший автор статьи.

Учёные задокументировали пищевое поведение пяти обычных видов карибских рыб и обнаружили, что они заметно различаются по рациону и месту кормления на рифе. С помощью генетического секвенирования они идентифицировали микробы из кишечника каждой рыбы и выяснили, что у каждого вида травоядных — уникальный кишечный микробиом.

Команда обнаружила, что некоторые члены микробиома, вероятно, широко распространены в океане, в то время как другие, по-видимому, являются резидентными микробами, которые могут иметь симбиотические отношения с рыбой. Эти «симбионты» нуждаются в животном-хозяине для жизни, и хотя некоторые процветали у нескольких видов рыб, часто они были уникальны только для одного.

Хотя в кишечнике рыбы одновременно могут обитать тысячи различных микробов, исследователи обнаружили, что лишь 59 типов микробов доминировали в кишечнике пяти изученных видов рыб.

Генетическое тестирование показало, что ближайшие известные родственники обнаруженных симбионтов — это микробы, живущие в кишечнике других рифовых рыб. Команда установила генетические связи между этими микробами.

«Наши симбионты были поразительно похожи на микробы, обнаруженные в кишечнике родственных рыб в других, далёких океанах», — сказал Джаррод Скотт, ведущий автор статьи. «Это указывает на то, что травоядные рыбы, разделённые миллионами лет эволюции и тысячами километров, тем не менее содержат сходные микробы».

Это исследование предполагает, что микробиомы рыб могут иметь экологическое и эволюционное значение в глобальном масштабе.

«Рассмотрение микробиомов как фундаментальной характеристики рыб может помочь нам понять, как функционирует океан, и скрытую роль микробов в природе», — сказал Рашер.