Множественное GWAS-моделирование выявило оптимальные аллельные комбинации локусов количественных признаков для яблочной кислоты в томате

Исследование, опубликованное в журнале Horticulture Research, было направлено на идентификацию локусов и расшифровку полигенной архитектуры содержания яблочной кислоты в плодах томата.

Методология и результаты:

• Авторы провели полногеномный поиск ассоциаций (GWAS) с использованием шести ключевых моделей и повторами в двух условиях среды.
• Из GWAS был выявлен ряд ассоциированных SNP-вариаций.
• На основе ведущих SNP и данных о накоплении яблочной кислоты было получено 15 аннотированных генов с высокой степенью достоверности.
• Была представлена оптимальная аллельная комбинация этих 15 локусов для получения более вкусных томатов.
• Для выявления потенциальных сигналов селективного сдвига по яблочной кислоте в процессе доместикации и улучшения использовались генетические параметры популяционной дифференциации.

Значение работы:

Авторы идентифицировали естественные вариации, лежащие в основе содержания яблочной кислоты в томате, с помощью множественного GWAS-моделирования. Это исследование дает новое генетическое понимание того, как содержание яблочной кислоты в томате эволюционировало в ходе селекции, и предлагает опциональные комбинации QTL для повышения его уровня.