Геном раскрывает тайны грибка, убивающего амфибий

Грибок, уничтожающий амфибий по всему миру, оказался гораздо старше, чем считалось ранее. Новое исследование предполагает, что его недавнее распространение в новые регионы, где у амфибий нет иммунитета, могло быть связано с глобальной торговлей дикими животными.

Ранее считалось, что группа родственных штаммов грибка Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), ответственная за текущую глобальную пандемию (так называемая Global Panzootic Lineage, GPL), возникла в результате недавнего летального скрещивания.

Однако международная команда исследователей, включая эколога из Корнелла Келли Замудио, секвенировала геномы 29 штаммов грибка Bd со всего мира. Результаты опубликованы в выпуске Proceedings of the National Academy of Sciences от 6 мая.

Ключевые выводы:

• Линия GPL существовала задолго до текущей пандемии. Её предок мог возникнуть 26 000 лет назад.
• Образец из Бразилии показал самое раннее известное расхождение с этим общим предком.
• Самые вирулентные штаммы, обнаруженные в Панаме и Коста-Рике (где сокращение популяций амфибий ведёт к вымираниям), имеют большую способность к дупликации определённых частей своего генома.

Грибок поражает около 350 видов амфибий, разрушая их кожу, что часто приводит к гибели. Массовое вымирание началось в 1980-х, а в 1998 году Bd был идентифицирован как причина.

Секвенирование генома открывает новые возможности:

• Понимание генетической вариативности патогена.
• Выявление конкретных генов, ответственных за вирулентность (например, вариации в генах, секретирующих пептидазы — ферменты, расщепляющие белки кожи).
• Исследование роли недавних изменений окружающей среды в повышении вирулентности.

Это исследование показывает, как современные инструменты, обычно используемые для изучения болезней человека, могут быть применены к вопросам биоразнообразия и сохранения видов.